岛本酵素菌技术是日本名古屋市岛本家族三代人历经80多年持续研究的成果。该技术的理论基础为自然生态学和营养免疫学，秉持“酶是生命之本”的核心观点，在自然环境中筛选出具有竞争优势的酵素菌群，主要由细菌、放线菌和酵母菌3个大类、24种有益生物菌组成，既有好氧菌又有厌氧菌，既有低温菌又有高温菌。
酵素菌群能够产生多种强活性的酶，好气性发酵能力很强，能迅速将有机质催化分解形成腐殖质从而提高土壤理化活性，为植物根系的生长壮大营造了良好的微生态环境。这是岛本酵素菌技术最重要的功效，因为“根系培育不好，作物繁茂不了；只有造好土，育好根才是栽培作物的根本之道”（岛本觉也）。酵素菌群在新陈代谢中会产生多种酶和活性物质，如淀粉酶、蛋白分解酶以及VB、核酸等活性物质，可以有效分解难溶矿物质、纤维素等物质，可以提高化肥的利用率。这些产物又能为菌群中放线菌提供营养物质，促进放线菌产生抗菌物质，抑制有害菌群的繁殖生长，减少作物病害。酵素菌群在代谢过程能产生一定ATP能量再加上其对土壤团粒结构的改善，能够让土壤均温提升2—3度，橘子在日本寒冷地区也能生长。
岛本酵素菌技术是一个完整的技术体系，由三部分组成：一、用酵素菌对作物秸秆、豆饼、鱼渣，棉籽饼、骨粉、木屑等进行有氧发酵，增加土壤有机质含量，改善土壤生态环境。二、用酵素菌对化肥、山土、页岩等进行有氧发酵，能提高化肥利用率，为土壤补充矿物元素。三、用酵素菌加红糖发酵后的菌液，加醋叶面喷施。这既是植物杀菌剂也是植物生长调节剂，促进作物生长，改善产品品质。相应的酵素菌产品有三类，酵素菌堆肥和作物重茬专用肥（土曲子），酵素菌粒状肥和液体肥，酵素菌叶面喷肥。
