据通报，农业部从2013年12月中旬起，在全国范围内组织开展了冬季种子企业监督抽查行动。从各地扦取水稻种子样品中随机抽取281个样品进行统一检测，涉及161家企业、250个品种，代表种子数量407.6万公斤；抽取棉花种子样品48个，涉及32家企业、48个品种，代表种子数量55.5万公斤。所有水稻、棉花种子样品均进行净度、水分、发芽率检测和品种纯度田间小区种植鉴定，水稻种子样品还进行了品种真实性检测（SSR分子标记法）。
经检测，281个水稻种子样品中，278个样品所检质量指标合格，3个样品不合格，质量合格率98.9％。抽查样品全部合格的企业158家，企业合格率98.1%。从检测指标看，所有样品净度、发芽率和水分均合格；品种纯度鉴定样品271个（10个样品因品种不真实，对品种纯度不作判定），合格样品268个，合格率98.9%。
48个棉花种子样品中，45个样品合格，3个样品不合格，质量合格率93.8%。抽查样品全部合格的企业29家，企业合格率90.6%。从检测指标看，所有样品净度和水分均合格；发芽率合格样品47个，合格率97.9%；品种纯度合格样品46个，合格率95.8%。
另外，经与农业部收集审定品种的标准样品比对，共有10个水稻种子样品真实性检测结果不合格。
