自2015年9月6日起，肥料登记行政审批进入农业部行政审批综合办公大厅办公，实施网上申请和纸质材料申请并行。申请企业通过“农业部行政审批综合办公系统”进行网上申请，同时将纸质申报材料报送至（或邮寄至）农业部行政审批综合办公大厅肥料窗口。网上申请和纸质申请材料均符合要求的，农业部行政审批办公大厅方予以受理。
《通知》明确将取消“三项规定”。按照简政放权的要求，结合肥料登记管理的实际情况，对相关规定进行调整：一是取消提交肥料样品的规定，省级农业行政主管部门在肥料登记初审时不再抽取肥料样品；二是取消质量复核性检测的规定；三是取消肥料残留试验、肥料田间示范试验资料的规定。
《通知》还提出了规范申报材料的7项要求，其中肥料田间试验报告，申请企业可按要求自行开展肥料田间试验，也可委托有关机构开展。
