阿合奇县积极在本地柯尔克孜羊品质改良工作上下功夫，通过组建核心群养殖基地、对种公畜补贴、羊人工受精等方式，有效提高了本地羊品质，取得了良好经济效益，推动了阿合奇县畜牧业健康有序发展。
组建核心群，促进柯尔克孜羊的品种改良。目前，阿合奇县已建立柯尔克孜羊核心群25个，其中，政府出资筹建21个，个人自筹建设4个。核心群共有基础母羊3750只，种公羊175只，经鉴定，核心群内所产羔羊出生重平均提高0.4公斤，种公畜平均体重提高2.6公斤。
对种公畜进行补贴，推动种公羊推广使用。阿合奇县通过对种公畜进行补贴的方式鼓励养殖户进行柯尔克孜羊品种改良，按照国家活畜良种补贴政策，每交易一只 带有自治区良补耳标的种公畜羊可获国家补贴800元。截至目前，共有6950只柯尔克孜种公羊享受了种公畜补贴，有力促进了优良种公畜的推广使用。
加强柯尔克孜羊人工授精推动羊品质改良。近三年来，阿合奇县共投入资金15万元，完成人工授精柯尔克孜羊5640只，通过人工授精所产羔羊，平均出生体重增加0.7公斤，成年体重增加2.8公斤。
