修订草案明确规定，禁止生产经营假劣种子，农业、林业等部门应依法对假劣种子进行打击，修订草案还界定了假、劣种子的范围。
全国人大法律委员会副主任委员张鸣起表示，中国种子生产经营者多、杂、散、弱，假劣种子、侵权种子扰乱市场秩序的情况比较严重，根据部分常委委员和地方、企业、科研院校建议，修订草案加大了对生产经营假劣种子、未取得生产经营许可证生产经营种子等违法行为的处罚力度。
草案规定，生产假种子最高可处货物价值金额二十倍罚款，并吊销种子生产经营许可证；生产劣种子最高可处货物价值金额十倍罚款，情节严重的吊销种子生产经营许可证。此外，因生产经营假劣种子而被判处有期徒刑以上刑罚者，在刑罚执行完毕后将面临五年时间的从业禁止期，不得担任种子企业的法定代表人或高级管理人员。
修订草案还进一步放宽了对种子生产经营的限制，将现行需由国家和省两级审定的二十八种农作物减少到五种，只保留稻、小麦、玉米、棉花、大豆；简化对符合规定的种子企业审定程序；同时取消了对引种林木良种审批的规定，改为备案制。
