2016年，农产品质量安全监管工作坚持“产出来”“管出来”两手抓，积极履行职责，全面加强监管，主要农产品例行监测总体合格率为97.5%，其中蔬菜、畜禽和水产品合格率分别为96.8%、99.4%和95.9%，全年未发生重大农产品质量安全事件。农产品质量安全呈现总体平稳、持续向好的发展态势，为“十三五”农业农村经济发展开好局、起好步提供了有力支撑。
标准化生产水平稳步提升。加快农兽药残留标准制修订步伐，新制定农兽药残留限量标准1310项、农业国家行业标准307项。推动各地围绕优势产业、主导品种制定标准化生产技术规范，开展“三园两场”标准化创建，引导龙头企业、合作社和家庭农场实行按标生产。稳步发展无公害、绿色、有机和地理标志农产品，在严格把关的基础上新认证产品1.3万个，扩大了特色优质农产品品牌的覆盖面和影响力。
专项整治深入推进。部署开展了禁限用农药、兽用抗菌药、“三鱼两药”、生猪屠宰、“瘦肉精”、生鲜乳、农资打假7个专项治理行动，切实解决面上存在的突出问题，防范各类风险隐患。截至目前，全国共出动执法人员247.4万人次，检查生产经营企业134万家次，查处问题2.1万起，查获假劣农资7844吨，为农民挽回经济损失4.8亿元。
质量安全县创建引领“五个率先”。按照国务院食安委“双安双创”现场会精神，推动各试点单位进一步加大创建力度，落实属地责任，创新监管模式。试点县在监管体系建设、标准化生产、全链条监管、全程可追溯、诚信体系建设等五个方面发挥了率先作用。据统计，平均每个试点县监管人员数量由创建前200多人增加到400多人，每年财政预算由30万元增加到200万元，试点县监测合格率达到99.3%、比创建前提高两个百分点，群众满意度达到90%，比创建前提高20个左右百分点。
质量安全追溯体系加快构建。研究制定农产品质量安全追溯体系建设指导意见。加快追溯信息平台建设步伐，制定相关技术标准和规范，编制农产品质量安全追溯试运行方案，做好试运行前期准备工作。开展食用农产品合格证制度试点，构建以产地准出市场准入为核心的全链条监管机制。
监管队伍能力进一步提高。谋划“十三五”发展，编制农产品质量安全提升规划和监管能力建设规划。加大例行监测和风险评估力度，基本摸清主要农产品风险因子种类、危害程度、产生原因及分布区域，增强风险预警和应急处置能力。组织开展第三届农产品质量安全检测技能竞赛，1271个地县质检机构的3761名检测人员参赛，激发和调动了广大基层检测人员学理论、钻技术的热情。加强基层监管、执法、检测人员培训和应急演练，通过各种形式来提升基层业务素质和能力水平。
