冬季气温低，菌丝和子实体生长缓慢，呼吸强度低，出菇量少，但菇肉厚、品质好。广大菇农要抓住春节期间市场需求量大、冬菇畅销价高的好时机，果断采取措施，争取多出菇，出好菇，取得较好的经济效益。具体管理措施有三条：
提高菇床温度，创造长菇条件冬季寒冷，只能靠自然气温，结合人为地调节。香菇棚揭去棚上的遮盖物，菇床上的薄膜除采菇须揭开外，其余时间罩紧；平菇棚把棚上遮盖物摊稀；蘑菇棚在菇棚的外表再覆盖一层薄膜。靠自然阳光的照射及菌丝自身的生物热量来保持菇棚内的温度，晚上棚外加盖遮阳网或草帘防冻防霜。一般采取以上措施后，棚内温度可提高5℃-10℃，在寒冷的冬季仍能正常出菇。
补水控湿，保暖防寒香菇、平菇经发菌和秋菇生长，菌棒失水较多，只有原重的50%-60%，这时应补水。补水前敞开棚门通风3至4天，补水时用注水针刺入菌棒内，借助水泵的压力，使菌棒在短时间内吸足水分，水源以井水为宜。喷水的原则是：喷雾状水，菇多时多喷，菇少时少喷，蕾期多喷，采收期少喷。蘑菇冬季基本不需进行补水喷水。
注意通风换气，避免寒风袭击菇蕾发生后，呼吸旺盛，如果空气不流通，二氧化碳沉积过多，就会抑制子实体的形成与生长。通风换气掌握在气温较高的中午前后进行，时间10-20分钟。进出棚内操作，从棚的南侧进出，防止干冷寒风袭击。
