一、药物预防是当前国内外首选的措施。使用抗球虫药时要定期更换或联合使用，因为球虫易对某些抗球虫病药产生抗药性，且这种抗药性虫体可以遗传。切忌超剂量使用，以免药物中毒。
二、对球虫的预防主要是加强卫生管理，保持舍内干燥，定期清粪，不让鸡接触粪便（笼养），并按综合性防疫措施的要求进行各种消毒。定期使用特定杀球虫的消毒剂（如邻二氯苯合剂）。为减少球虫感染，最好采用笼养或网上平养。
三、切断球虫体外生活链，如保持鸡舍通风干燥，饲养密度适当。
四、在4~14日龄以饮水方式投服球虫疫苗，对预防鸡球虫病有效。
五、鸡发生球虫病后，易继发感染魏氏梭菌，所以要注意预防梭菌性肠炎。
六、治疗鸡球虫病的药物有磺胺吡嗪、磺胺喹恶啉、莫能菌素、马杜霉素、盐霉素、海南霉素等。也可用中草药复方球虫散：地榆20克，木香20克，甘草5克，山楂15克，大黄5克，黄芩15克，青蒿10克，黄连10克。按每千克体重1.2~1.8克用量煎水或拌料，连用5~7天。
