在食用菌生产中，由于连续栽培，杂菌越来越多，致使发菌成功率急剧下降，出菇期也极易感染病害。轻者减产，重则失败。
那么，在食用菌连续栽培生产中，怎样防止污染呢？
在食用菌生产中，出现的杂菌有一定的专适性。平菇杂菌不影响香菇，香菇杂菌不影响木耳等等，就是在同一个类型的不同品种之间也不容易交叉感染。所以，应注意更换品种。
在场地充足的情况下，每年利用新棚栽培，可以有效地防止杂菌污染。如更换品种和更换场地都不方便的话，也可以采取生物降解的方法，即在每年麦收前后，清理废料，卸除顶棚。在棚内种一些粮食作物或蔬菜，也可以任其生长杂草。这样，经过夏季的风吹、日晒、雨淋和植物的分解吸收，就可以复原一个新场地。
