(1)由于营养不良或者疾病等因素导致猪只本身免疫功能失常，免疫接种后不能刺激猪体产生特异性抗体。为追求利润，某些预混料厂家不按质量标准配制预混料，或某些原材料供应商供给客户劣质假冒原料，都会影响免疫效果。
研究证明：机体维生素、氨基酸及某些微量元素的缺乏或不平衡等都会使机体免疫应答能力降低。如维生素A的缺乏会导致淋巴细胞的萎缩，影响淋巴细胞的分化、增殖，受体表达与活化，导致体内的T淋巴细胞减少，吞噬细胞的吞噬能力下降，B淋巴细胞的抗体产生能力下降，导致机体免疫应答能力降低。
当饲料发霉产生的一系列的霉菌毒素如黄曲霉素能影响机体免疫效果，据报道，当饲料中的黄曲霉素大于0.1ml/kg时，能明显减少机体内免疫球蛋白和T淋巴细胞的数量，使机体免疫应答能力明显降低。
(2)母源抗体的干扰，母源抗体能干扰疫苗的抗原性，因此在使用疫苗前，应该充分考虑猪体内的母源抗体水平，必要时要进行检测，避免这种干扰。
(3)没有按规定免疫程序进行免疫接种，使免疫接种后达不到所要求的免疫效果。
(4)猪只有病，正在使用抗生素或免疫抑制药物进行治疗，造成抗原受损或免疫抑制。如地塞米松、痢特灵、氯霉素、卡那霉素及某些磺胺类药物等对B淋巴细胞的增殖有一定的抑制作用，影响猪的免疫应答。尤其在免疫前后不规范地使用这些药物，可导致机体白细胞减少，从而影响免疫应答。
(5)疫苗在采购、运输、保存过程中方法不当，使疫苗本身的效能受损。
(6)在免疫接种过程疫苗没有保管好或操作不严格，或疫苗接种量不足。
(7)制备疫苗使用的毒株血清型与实际流行疾病的血清型不一致，也不能达到良好的保护。
(8)在免疫接种时，免疫程序不当或同时使用了抗血清。
应对措施：
(1)首先得建立具有高免疫力基础的猪群，使猪群在接受疫苗接种时能及时作出免疫应答。同时提供免疫器官及抗体维持与产生所必须的某些营养素，如：蛋氨酸、苏氨酸、VA、VC等。
(2)免疫程序存在缺陷是造成免疫失败的又一原因。制定合理的免疫程序的关键是如何排除母源抗体的干扰，确定合理的首免日龄。在条件许可的情况下，我们尽可能作母源抗体水平监测，随时调整仔猪的首免时间，使仔猪首次免疫避开母源抗体干扰，而又不给野毒提供感染机会。
(3)根据各类疫苗的特殊要求保存、运输及稀释注射。疫苗使用过程中应注意以下注意事项：稀释后的疫苗不能在2小时内用完，疫苗失效;用碘酊或其他消毒液消毒针头，人为杀死弱毒疫苗;用大号针头注射，导致疫苗外漏;打飞针，免疫剂量不足和漏注;用一个针头打到底，打防疫变成带毒传播。
