一、棉田土壤培肥技术
棉花与草木犀或苜蓿豆科绿肥作物套（轮）作。每年6—7月份灌水前在棉田套种草木犀或苜蓿，棉花收获后草木犀或苜蓿越冬，第二年春季棉花播种前翻入土壤。
施用棉籽粕或畜禽粪等有机肥。棉花播种前每公顷基施棉籽粕6000千克或牛羊鸡粪肥7500千克以上。另外每公顷备用1500千克棉籽粕（堆制腐熟），于棉田灌第一水前开沟追施。
二、品种和种子的选择
根据有机农业认证标准中禁止采用转基因品种、合成物质处理种子以及尽可能使用有机种子的要求，经四年的试验示范和生产，确定中棉所35为当前较适宜的有机棉种植品种。
种子加工采用机械脱绒，不用任何化学物质处理。除第一年无法获得有机种子外，从第二年起全部种植上一年生产的有机棉种子。
三、密度
新垦荒地，土壤肥力低，棉株的个体发育较小，在前2—3年内应靠群体增加总铃数，因此一般采用高密度种植方式，每公顷19.5万—22.5万株；第二年，密度18万株左右；达到中等肥力时，应在12万—15万株。
四、棉花生长调控
1．灌水调控。适当推迟棉田第一水，防止蕾期生长过旺，以后各次灌水也应适期适量，以控制棉株营养生长速度，防止旺长而造成田间荫蔽。
2．去枝叶，适当早打顶、打边心。在棉花现蕾后，及时去除叶枝，有机棉由于禁止使用缩节胺等生长调节剂，棉株营养生长较快，为控制株高和果枝长度，减少田间荫蔽，应适当早打顶、去边心，留果枝8—9个，每果枝留果节1—2个。
五、害虫防治技术
1．农业防治。进行秋耕冬灌，降低棉铃虫、地老虎等蛹的越冬基数。适时定苗、中耕除草、整枝打杈。剔除重株，可消灭部分害虫的卵和幼虫。
2．生物防治。采用棉花与玉米、小麦、油菜、高粱等地块邻作，或在棉田内、田边、沟旁点种玉米、高粱等诱集作物，为天敌提供适宜的栖息和繁殖的场所，增加天敌的种类和数量。利用微生物杀虫剂防治害虫，如Bt、核多角体病毒具有较强的专一性，对人畜、农作物和天敌无害，不污染环境，对害虫毒性较高，不易产生抗性。或利用性诱剂诱捕成虫。
3．物理机械方法防治。棉田安装黑光灯、高压汞灯诱杀棉铃虫成虫。在棉铃虫羽化盛期，杨树枝捆成束竖立在田间地头或渠道两旁诱集棉铃虫成虫。苗期可在棉田周围间隔20米处放糖浆瓶一个，诱杀地老虎成虫。棉田周围和中间渠埂放置黄色胶板诱捕蚜虫。
4．使用植物性杀虫剂。在棉花受到直接威胁时，杀虫皂（钾皂）和植物性杀虫剂，如除虫菊、鱼藤酮、鱼尼丁、沙巴草、茶、苦木制剂、苦参碱等，可用于防治害虫。
六、草害防治技术
在棉花的生产过程中，通过精选种子、施有机肥、合理密植、地膜覆盖、机械和人工除草以及科学合理地与其他作物轮作换茬，改变其生态和环境条件，都可明显减轻杂草的危害。
七、病害控制技术
种植抗病品种，如中棉所35等，不用发病棉田生产的种子，以防止病原菌随种子带入土壤；常规棉田的棉秆禁止带入有机棉田；棉花与其他作物轮作倒茬，使危害棉花的病原菌逐渐减少；施用的棉籽粕等有机肥须经过高温加工处理或高温堆制处理，以杀死其中的病原菌；在棉花播种前，进行日光晒种或温水浸种，可起到杀菌的作用；有机棉田和常规棉田混用的机械设备工具，在用于有机棉田时必须进行清洁；在棉田中如发现病株，应拔除以病株为中心1m2内的棉株。
