1.低温贮藏法
(1) 常温保鲜
采收后的新鲜金针菇经整理后，立即放入筐、篮中。其上覆盖多层湿纱布或塑料薄膜，置于冷凉处（自然气温20℃以下），一般可保鲜1-2天。
(2) 简易包装后低温保藏
新采收的金针菇经整理后，用低密度聚乙烯薄膜袋（DpE）袋膜厚20毫米，分装，抽真空封口，将包装袋竖立放入专用筐或纸箱内，1-3℃低温冷藏。可保鲜13天左右。
2.化学保鲜法
采用对人畜安全，无毒的化学物质用于浸泡或喷洒在金针菇表面，以达到延长金针菇新鲜的目的。可用于金针菇保鲜的化学物质有：焦亚硫酸钠、氯化纳、稀盐酸、高浓度的二氧化碳、保鲜剂、抗坏血酸及比久等。
(1) 焦亚硫酸钠喷洒保鲜 用0.02%焦亚硫酸钠溶液漂洗金针
菇以除去泥沙碎屑，再用0.05%焦亚硫酸钠溶液浸泡10分钟护色，捞出沥干后分装塑料袋中可保鲜数天。
(2) 氯化纳（即食盐）、氯化钙液保鲜 用0.2%食盐液加0.1%
氯化钙制成混合浸泡液，将刚采收整理好的金针菇浸泡上述混合液中，要求菇体浸入液面以下30分钟，捞出沥干分装塑料袋中，可保鲜数天。
