三七由于常年生长在荫蔽湿润的环境中，三七黑斑病、圆斑病、疫病、锈腐病，白粉病等多种病害发生危害较重，常年因各种病害造成的损失达30%～40%，严重者达80%以上。三七出苗、长叶阶段，植物柔嫩、根系不发达、抗逆性差，是多种病菌初次侵染的重要时期，若春雨早而频繁，病情发生蔓延迅速，危害损失严重。三七从播种到出苗一般需要60～75天，加强这段时间园田管理，促进三七健壮生长，对控制病害发生发展关系密切。因此，抓住时机，作好综合防治，控制三七苗期病害发生危害，是三七病害综合防治的关键。主要措施是：
1.抗旱浇水，防涝排湿 俗话说“水是七的命，又是七的病”，就是说水分过多过少对三七生长都不利。土壤水分不足或干旱，播种后的三七会变干而成“响子”，子条也会变软，继而干缩、霉烂，均不能正常出苗。因此，干旱地根据墒情适时、适量浇水，防止浇水过多和避免忽干忽湿；低凹地疏通沟道及时排水，是确保三七正常出苗，提高植株抗病性、减轻发病的关键。
2.调整荫棚 根据各年生三七对光的要求和季节变化特点，进行修补、调整荫棚，满足三七对光的要求，也是促进三七健壮生长控制病害发生发展的重要措施。
3.清除杂草 杂草与三七争夺养分、水分和空间，对三七生长影响较大。同时杂草又是多种病源的寄主。因此，及时清除杂草，可促进三七健壮生长，减少病害发展蔓延。
4.合理追肥 三七出苗后应根据土壤肥力、底肥情况和苗情，按氮2、磷1、钾3的配比，进行合理追肥，提倡少量多次追肥，氮、磷、钾混施，适量增施钾肥，以提高植株的抗病性。
5.药剂防治 三七出苗前用多菌灵1份加粉锈灵1份，兑水500～600倍，或用5波美度石硫合剂进行墒面消毒一次，每次相隔10～15天，可预防白粉病等多种病害。出苗后要经常检查，发现中心发病株后应作好标记，清除病残株后重点防治。可酌情选用以下药剂和配方均匀喷雾，相隔7～10天喷一次，连续防治2～3次。
防治子秧立枯病 用30%土菌消（恶霉灵）1000倍液，或用50%多菌灵200～400倍液，或用1∶1∶150波尔多液喷淋或浇灌，可封锁发病中心，控制病情蔓延。
防治二、三年三七苗病害主要病害有疫病、黑斑病、圆斑病、炭疽病、锈腐病、白粉病及茎腐病等。出苗前用20%粉锈灵加70%甲基托布津800～1000倍液，或用50%多菌灵加70%代森锰锌600倍液，或用多菌灵加福美双800倍液喷雾，可预防病害或减轻危害。三七出苗后，经常检查，发现发病中心后，及时清理封锁，选用以下药刑及时防治。
①防治三七黑斑病 用1.5%多抗霉索150～200倍液，或用75%百菌清500～600倍液，或用40%菌核净400倍液喷雾。
②防治三七圆斑病 用30%爱苗2500倍液，或用10%宝丽安加50%腐霉利1500倍液，或用60%世达800倍液喷雾。
③防治三七疫病 用80%三乙磷酸铝500倍液，或用72%克露550倍液，或用58%甲霜灵锰锌500倍液，或用64%杀毒矾500倍液喷雾。
④防治三七炭疽病 用70%代森锰锌500倍液，或用70%甲基托布津1000倍液，或用30%福嘧霉1000倍液喷雾。
三七苗期同一时期常有两种或两种以上病害发生，为此根据病情提倡不同特性的杀菌剂混合使用，以减少喷药次数，扩大防治对象，降低防治成本，提高防治效益。
