病毒病是甜（辣）椒生产过程中的主要病害。发病早的影响植株正常生长，形成“小老头”状；发病迟的形成花叶、花脸果，影响光合作用及其商品性，往往造成较大的经济损失。
为帮助农民解决这一难题，屯留县经过3年的研究和试验示范，初步探索出了一些行之有效的综合防治措施。具体如下：
一、症状：
主要症状有花叶、畸形和丛簇、条斑坏死等3种。花叶：病叶出现浓绿与淡绿相间的斑驳，叶片皱缩，易脆裂，或产生褐色坏死斑。叶片畸形和丛簇在初发时心叶叶脉褪绿，逐渐形成浓淡相间的斑驳，叶片皱缩变厚，并产生大片黄褐色坏死斑。叶缘上卷，幼叶狭窄如线状，病株明显矮化，上部叶丛簇状。果实染病，花脸般浓淡相间，形成褐色坏死斑，病情沿叶柄扩展到枝、主茎及生长点，出现系统坏死性条斑，植株明显矮化，造成落叶、落花、落果。
1、病原：
甜（辣）椒病毒病的病原主要有：黄瓜花叶病毒（CMA）、烟草花叶病毒（TMV）。黄瓜花叶病毒导致系统花叶、畸形、簇生、蕨叶，叶片出现坏死斑及条斑等。烟草花叶病毒主要是前期为害，常引起急性坏死斑或叶脉坏死及顶端坏死。
三、发生特点：
病毒病主要是昆虫传毒与接触传毒两种方式。昆虫传毒媒介有蚜虫、蓟马、飞虱等，传播的病毒是黄瓜花叶病毒。传毒昆虫从周围杂草吸取有毒汁液而带毒在甜（辣）椒上刺吸传毒。接触侵染的病毒是烟草花叶病毒，借分苗、整枝、管理等农事活动的接触、磨擦传播。连作、地势低洼、缺肥、缺水、作物长势弱和高温，均有利于病毒病的发生。
四、防治措施：
1、选用抗病品种：如北京中椒4号、湘研16号、超级绿霸16号、并丰207、农研16-2等，都比较抗病、耐病。
2、农业管理措施：（1）轮作倒茬。可有效降低侵染机会。（2）与高秆作物间作。如间作玉米可遮阴降温、降低病毒病、疫病、日灼病等发病率。（3）清洁田园，秋深耕。病果病叶不要随便丢弃，要带出田外，焚烧或掩埋。秋耕深度在15厘米以上，将病残体翻入土内。
3、培育壮苗：①晒种。在日光下晒种2～3天，将种子表皮的病菌除去；②浸种。将晒好的种子放入一容器中，加入25℃的热水，浸泡3～4小时；③温汤浸种。再用一个容器，将浸过种的种子放入，先放冷水，再加入25℃的热水，温度升致55℃达半小时，然后自然降温；④药剂处理。用10%磷酸三钠浸种10分钟，然后清水淘净；⑤催芽。干种子播种，20多天才能出苗，催芽后7～8天就可出苗；⑥苗床土壤处理。播种前，在苗床上，每平方米用9克多菌灵掺入5公斤土内。毒土下铺上盖，这时的苗床温度要控制在25℃～30℃。覆土要注意：太厚，则出苗弱；太薄，则带帽出土。要掌握在1厘米的厚度。出土后，苗床温度控制在25℃～28℃，当2个枝叶出来后，生长点开始生长，这个时期叫破心期，也是最脆弱的时候，易得猝倒病，应用普力克或克露喷1～2次。
4、确定定植期：青椒既是喜温作物，但又怕高热，因此要适时定植，早了易出现老苗；迟了，封不了垄，造成地温高，根系受到伤害，水分上不来，易得病。定植以后，要快缓早发，需喷一次生长调节剂，喷与不喷，生育期差10天左右。
5、合理浇水：青椒喜水又怕水，水浇的多了，根系滞吸，衰弱，因此要小水勤浇，地要整平，渠系配套。
6、合理施肥：提倡平衡施肥，青椒需肥的比例是：N∶P∶K=1∶0.5∶1.2～1.4，后期一定要增施钾肥，提高植株抗逆力。
7、物理防治：用防虫网防传毒媒介如蚜虫、飞虱等，能大大降低病毒病的发病率。
8、化学防治：所用的药剂有：①盐酸吗淋呱乙酮，商品名：病毒A、毒克星、病毒先丰，病毒速克；②菇类蛋白多糖，商品名：菌毒宁、抗丰素、抗毒丰、抗丰剂1号、病毒黑杀手；③植病灵。在病害较轻的情况下，可任选一种进行喷施；如果发生较重，占到20%～30%，就必须三种药同时混合起来喷施，要达到“淋洗”，三天一次，连喷三次。
