由于疫苗质量差、忽视局部免疫、防疫程序不合理、疫苗选择不当、免疫抑制病的干扰等因素，导致非典型性新城疫普遍存在。
防治：
（一）选择优质疫苗，制定科学免疫程序。活苗要选择用SPF（无特定病原）鸡胚生产、没有污染的；灭活苗要选择抗原含量高、副作用小、维持时间长的优质疫苗；免疫程序的制定要根据抗体水平监测结果，结合本地实际情况。
（二）加强黏膜保护，提高局部免疫水平。除了加强饲养管理、保证营养全面外，还要加强对支原体的控制。这就要从父母代种鸡采取措施。父母代种鸡支原体控制得好，就不会通过种蛋垂直传播；更重要的是母源抗体可保护雏鸡7～9天的时间，可确保新城疫活苗的首免成功。所以父母代种鸡支原体油苗的注射是十分必要的。另外，在活苗免疫前后使用控制支原体的药物也是很关键的。
（三）提高鸡体内循环抗体水平。早期进行新城疫油乳剂灭活苗的注射。灭活苗一定要选择抗原含量高、注射剂量少、刺激性小的优质疫苗，这样才能保证鸡产生持久而坚强的循环抗体水平。
（四）定期消毒。消毒能够减少环境中的病原体数量，大大降低鸡群发病机会。其中消毒剂的选择十分重要，现有消毒剂中，安全高效的当属碘制剂，但是络合技术不好的碘刺激性比较大，所以一定要选择优秀的络合碘。
（五）加强饲养管理。健康的鸡才会产生很好的免疫应答。应该保证鸡合理的营养需求，保持饲料、饮水卫生，防止有害物质污染，减少应激因素。注意观察鸡群采食、饮水、排粪等情况，发现异常立即采取有效措施。
（六）控制垂直传播的免疫抑制病。做好种鸡的防疫和饲养管理工作，切断疾病的垂直传播，保证其后代健康。
