目前本病，无特效疗法。对于HEV在自然界的稳定性，病毒在体内存在的时间，都不十分清楚。实际工作中主要靠加强综合防疫工作，防止引入病猪。对于发病猪和猪群要及时隔离，临产前2-3周使母猪感染HEV，经一定时间后可产生母源抗体，仔猪可通过初乳获得保护。疫苗使用前要检查疫苗玻璃瓶有否破损、污染等异常现象，有则废弃，疫苗打开后限在当天用完。
在大多数猪场，HEV感染主要呈现经呼吸道传播的亚临床感染。母猪往往在头胎分娩前已经接触到病毒，因而可以通过初乳传递抗体使其后代得到保护。这些仔猪即使发生感染，也多是呈现亚临床状态，很少引起暴发。在新建的猪场或养猪数过少的小型场，病毒难以持续存在，母猪在分娩时往往缺乏免疫力，仔猪在出生后几周内可能被感染并出现症状。
本病为散发，一般不进行免疫接种。临床上一旦出现明显症状，多以死亡告终。此前未产生免疫力的母猪所生的仔猪，可在出生时接种特异性高免血清。
