选定优良亲鱼是搞好锦鲤繁殖的关键。采用自然繁殖，首先要选择合乎标准的亲鱼。在北方，前留作种鱼的锦鲤，在室内渡过冬季后，于3月中下旬移至室外鱼池中饲养。此时，应进一步精选亲鱼，以获得优良的后代。
（一）亲鱼的选择作为繁殖用的亲鱼，一般要具有以下：体质健壮、色泽鲜亮晶莹、吕系纯正、品种特征明显、色斑边际清晰鲜明，无虚边、无疵斑、鳞片光润整齐、游姿稳健及各鳍完整无缺陷。
（二）雌雄鱼的鉴别方法锦鲤到成熟年龄，雌鱼和雄鱼形态就有了差别。一般来说，雌鱼身体短粗而丰满，腹部膨大，越接近临产时腹部膨大越明显，头部稍窒息窄并较长；雄鱼的体形较瘦长，且部宽而短，额部稍突起。雌鱼的胸鳍端部呈圆形；而雄鱼的胸鲤端部略尖，在生殖季节，雌鱼与雄鱼的区别更为明显，雄鱼胸鳍的第一根鳍条和鳃盖上出现若干白色烂状小突起，称为“追星”。生殖季节过后追星则自选消失。雄鱼生殖孔小而下凹，用手轻压有乳白色精液流出；雌鱼生殖孔稍宽而扁平，微有外突，用手轻压腹部有卵粒泄出；锦鲤繁殖时，雌雄亲鱼数量搭配适当与否，与卵子受精率高低关系极大。为了保证精子数量充足，提高卵子的受精率，雌鱼与雄鱼搭配比例是1：3（1发声雌鱼与3尾雄鱼组成一组或1：2或2：3效果较好。若雄鱼数量少，采用雌雄鱼搭配比例1：1的方法也可。2－3龄雌锦鲤的生殖腺刚发育成熟，生殖机能不旺盛，因而怀卵量少，卵烂亦小，孵化出的仔鱼容易发育不良，一般都不选作亲鱼。适龄繁殖的亲鱼。适龄繁殖的雌鱼一般在4－10龄；而雄鱼也要在3－5龄以上，这样的亲鱼，体质健壮，生殖腺饱满，卵子和精子的活力强，受精率和孵化率都较高，用作亲鱼最为理想。
（三）产卵池的准备采用水泥鱼池作产卵池，鱼池面积是4米X4米的方形池或4米X5米的长方形池较为适宜。鱼池不宜过大，过大不便管理，过小又影响亲鱼的产卵活动，水深30－40cm，以含氧量充足，水质清洁、氢离子浓度39.81－63.09nmol/L（PH7.2－7.4）微大性，硬度低的水质为好。
（四）鱼巢鱼巢是用来附着鱼卵的，产卵之前要将鱼巢准备好。一般以狐尾藻、棕树皮、柳树须根（要经多次煮过）等作鱼巢较好，把它扎成小束，即可使用。
（五）产卵在北方地区，4月下旬至6月中旬是锦鲤产卵的季节，当水温上升至16－18摄氏度时，就可将亲鱼移入产卵池，发现亲鱼有急促追逐现象时，即可旋转鱼巢于产卵池内，当水温上升到20摄氏度时，即可大量产卵，产卵的时间是在黎明4时左右开始直到上午10时或中午为止。如果天气发生突然变化，水温急剧下降时，则会中断产卵。一般1尾30－40cm长的锦鲤产卵量为20－40万粒，还有的在产卵约1个月以后，会再产出前次未产尽的余卵。其卵与金鱼的卵一样，也是体外受精，属粘性卵。卵烂的大小，因母体大小和年龄的不同而异，母体大，卵径也大；反之，则卵粒也小，其卵径一般2.1－2.6毫米，受精卵吸水后，卵径要比未受精卵大些。将已布满附着卵的鱼巢，从产卵池内取出后，在5－7%的食盐溶液中浸5分钟，或万分之一的孔雀石绿溶液中浸10－15分钟。或3ppm的甲基蓝溶液中浸15分钟，进行消毒，而后再移入孵化池中孵化。用这些药物放，对预防水霉病的发生，有一定效果。
（六）孵化首先要准备孵化池，用3米X3米面积，水深30cm的水泥池。孵化池的水温要与产卵池水温相同，水温低于或高于产卵池水温5摄氏度时，会降低孵化率，水温差再加大会使卵死亡。其孵化期的长短与水温高低有关，孵化池水浊20摄氏度时，约经4天即可孵化出仔鱼，水温愈高，所需孵化时间则愈短，反之，孵化时间则长，一般说在水温18摄氏度左右时经4－5天即可仔鱼；在20－22摄氏度时，经3－4天可仔鱼；到25摄氏度时，经3天即可仔鱼。孵出的仔鱼，不食不动，依靠卵黄囊中的营养物质，维持鱼体生存需要的能量。用鱼体上的附着器官吸附在鱼巢上，当卵黄囊内的营养物质被吸收完毕时，仔鱼开始游动觅食，这时可开始投喂饵料，饵料的种类及喂养的方法与喂养金鱼仔鱼的方法相同。除上述方法外，还可采用流水孵化法，此法要注意流速的大小，开始水流可以大些，将附着鱼卵的鱼巢移入置于流水中的小网眼的孵化网箱内，流水中掌握量较高，有利于鱼卵的孵化，当鱼苗孵出后要减小流速，或置于静水网箱中继续发育。否则会冲伤仔鱼，或因仔鱼游动量大而水泵体力对发育不利。
