1.保护肠道黏膜，促进肠黏膜的修复。球虫在鸡体内要经过裂殖增殖和配子生殖阶段，其中当裂殖增殖阶段的裂殖体在肠上皮细胞内大量增殖时，破坏了肠黏膜的完整性，引起肠管发炎和上皮细胞的崩解，发生消化机能障碍，营养物质不能吸收，且大量出血，产生毒素，引起自体中毒。肠黏膜的损伤为致病性病原微生物的侵入提供了便利条件。因此在临床治疗过程中应采取措施修复和保护肠道黏膜，以提高鸡对球虫和其他病原微生物的抵抗力。如用次碳酸铋、活性炭、白陶土等收敛剂，笔者认为“毒痢克”效果最好。
2.止血、消炎。急性盲肠球虫和小肠球虫都能不同程度地引起肠道出血，并引起肠黏膜的溃疡、坏死、脱落等，易继发和并发其他疾病，从而增加病情和加大死亡率。止血可采用维生素K3、安络血等药物，采用硫酸安普霉素、丁胺卡那霉素、新霉素等抗菌药物，防止大肠杆菌等细菌性疾病的继发或并发。
3.补充体液、消除自体中毒，调节体内电解质及酸碱平衡。鸡球虫病的发生会造成血液和组织液的大量流失，以及自体中毒。因此，在治疗本病的同时应添加电解质、多维素等。消除自体中毒可采取“先泻后复”的措施，先用泻药促进毒素及坏死黏膜的排出，然后再用肠道收敛剂止泻修复肠黏膜。
4.增加营养。在养鸡生产中，鸡的必需营养物质达35种以上。鸡球虫病可导致营养不良，影响免疫应答，增加对疾病的易感性。故此须增加营养：(1)补充能量：在饲料中额外加入适当玉米或葡萄糖。(2)提高蛋白质水平：在鸡的日粮中适当增加豆饼或鱼粉的含量。(3)维生素、矿物质、氨基酸等应据病情科学合理添加。
5.健肾利尿。目前治疗球虫病的药物大多仍采用磺胺类药物，磺胺类药物的长期应用易造成肾脏严重损伤，引起肾肿、尿酸盐沉积、机能障碍等，可采用肾宝、肾肿解毒药、乙酰水杨酸、小苏打等药物治疗。
6.加强饲养管理和环境卫生。在给药治疗鸡球虫病时，饲养管理跟不上，环境卫生差，都会不同程度地降低药物对球虫的敏感性。因此必须加强饲养管理和环境卫生，尽可能给鸡创造一个良好的适宜的生长环境。
