近年来，玉米螟对抗虫棉的为害逐年上升，广大棉农种植抗虫棉时应注意防治玉米螟。
玉米螟的幼虫从棉株的幼嫩分杈处或叶腋间钻入主茎和果枝，造成枯枝、断茎，甚至死亡。其幼虫还能吐丝随风飘移转移为害。据田间调查：第一代、第二代玉米螟的发生为害期与第二代、第三代棉铃虫的发生为害期基本一致。抗虫棉的第二代棉铃虫一般不需防治，此时正值棉花蕾期，棉株生长幼嫩，最易遭受玉米螟的为害，而且为害严重。随着抗虫棉的推广种植，用药防治棉铃虫的次数大大减少，玉米螟也得不到有效防治，其为害越来越严重，由次要害虫上升为主要害虫。从多年田间调查看，玉米螟在分散棉田的为害重于集中棉田，故分散棉田更要注意搞好玉米螟的防治工作。
在玉米螟产卵盛期、幼虫孵化初期，有虫棉株达到3%时应立即防治。要选用对天敌较安全的农药，可选用35%硫丹乳油1000倍、20%灭多畏乳油1500倍、2.5%功夫菊酯1000倍、或40%水胺硫磷乳油800倍液进行喷雾。在棉花打顶之前，使用100倍的40%久效磷乳油、或35%棉安磷乳油100倍液滴注棉株顶心，既有良好的防治效果，又能保护天敌。另外，结合田间整枝等管理措施，进行人工灭卵、捉虫，将打下的枝杈带出田外，可消灭大量害虫。
