1.空间消毒
在播种或定植前7～10天进行。每立方米用硫磺4克、锯末8克混合均匀，放在容器内燃烧，时间宜在晚7点钟进行，熏烟密闭24小时。也可以按每立方米用25%百菌清1克，锯木8克混匀，点燃熏烟消毒。
2.棚架、设备、工具等消毒
用1:50～1:100的福尔马林水溶液洗刷或者喷洒均可。
3.土壤消毒
根据大棚土壤的病虫害种类选用农药，在定植前10～15天进行。枯萎病发生严重的大棚、可在畦面或沟面喷浇100～200倍福尔马林液，然后用薄膜覆盖5天，半月后药剂全部挥发完毕，即可播种和定植。其他病害可用50%多菌灵、50%托布津或70%敌克松1000倍液喷洒，或制成毒土撒布后翻入土中。有地下害虫的大棚，可以在土壤处理时加一定数量的杀虫剂。
4.定植沟消毒
枯萎病重的地块，在种植前进行土壤消毒或者消毒质量不好的，还可以在定植沟内，每亩用50%托布津1.25千克或50%多菌灵0.75千克或70%五氯硝基苯1千克左右进行消毒。以上药剂要先按药粉1份和细干土100份掺拌混合均匀，然后撒布在定植沟内。
