鸡爪菌属于竞争性杂菌，使鸡腿菇栽培中的主要病害。鸡爪菌尤其在春季更容易发生，传播很快。鸡腿蘑前期菌丝生长阶段发生鸡爪菌侵袭时，养分受到破坏，影响正常生长；后期随着鸡爪菌的菌丝蔓延，分泌出一种有害的胞外酶，蚀袭鸡腿蘑菌丝，使菌丝逐步萎缩，无法转入生殖生长，以致不出菇。防治鸡爪菌的措施如下：
一、优化场地，堵绝病原菌。栽培场地土壤、杂草、垃圾等是鸡爪菌繁殖的地方。要杜绝污染源就要做到“三强调”。①强调水旱轮作，1年种农作物，1年种菇；②强调环境卫生，提前清除周围杂草垃圾与废料；③强调消毒灭菌，场地翻土晒白，用石灰水喷洒消毒。
二、科学配料，杀灭潜存有害菌。鸡腿蘑是用棉籽壳、玉米芯、蔗渣等作为原料，而这些原料中往往附着有害菌孢子。要根绝就得做到“三必须”。①必须选料曝晒，选择无霉烂变质的原料，并曝晒1-2天，利用阳光紫外线杀灭有害菌孢子；②必须配方合理，掌握原料（棉籽壳或玉米芯等）占85%，麦麸10%，石灰粉3%，石膏粉1%，复合肥1%，加水110%，pH7-8；③堆料必须充分发酵，发酵是杀灭鸡爪菌的有效手段，将原料加水拌匀后，堆集发酵7—9天。当料温上升至70℃后，每天翻堆1次，连续4—5次，同时料堆温度维持在70—75℃。达到料色棕褐，呈现大量放线菌菌丝及孢子，有香味，pH7.5为宜。
三、选用优质无杂菌种。为根绝鸡爪菌，选用优质无杂菌种。为此严格执行“四要求”。①料袋灭菌要求100℃后持续10—12小时；②接种要求无菌操作，防止“病从口入”；③培养室要求事前消毒杀菌，可用气雾消毒盒或硫磺熏烟消毒；④培养室要求温度23-25℃，不超过28℃，室内干燥，避光，注意通风，抑制病菌发作。
四、讲究覆土，强化消毒。鸡腿蘑不覆土就不出菇，但土壤中病源菌较多，为此必须“四注意”。①注意选土，选择没发生过鸡爪菌的土壤作为覆土材料；②注意消毒，覆土材料曝晒2-3天后，再用2%石灰粉拌匀消毒；③注意灭菌，将覆土材料集堆后，按照每1立方米的土拌1公斤甲醛的办法，拌土后覆盖薄膜，保持 1-2天，然后打散排除废气；④注意土质含水量，覆土含水量不超25%。
五、出菇管理，营造环境。鸡腿蘑出菇阶段也是鸡爪菌子实体发作时期，为此必须采取“五控制”。①控制水源污染，长菇期喷水禁用池塘水、沟水等污染水质；喷水增湿空间相对湿度不超过95%，以防有害菌孳生；②控制光照度，菇棚光线以500-1000勒克斯散射光为宜；③控制有害气体，长菇期加强通风，保持菇棚空气流畅；④控制与有害菌混生，一旦发现鸡爪菌迹象，立即把菌丝连同培养料一起挖出，远离菇房处理，并在患处撒上石灰粉，防止蔓延，或采用“鸡爪菌立灭王”药剂杀灭。⑤控制成熟期，覆土后10-15天菇蕾大量发生，菌柄抽长、菌盖饱满时即可采收，防止过熟霉烂引起鸡爪菌侵蚀。
