一、病害防治
病害就是指鸡腿菇在生长发育过程中，因受其他有害微生物的侵扰或环境条件不适宜，使其不能正常进行生长发育，甚至死亡，对生产造成损失的现象。鸡腿菇病主要有以下几种：
1、褐腐病
褐腐病一般发生于菇体及培养料面的菌丝上，起初被病菌侵入的部分长出白色棉毛状的菌丝，其表面逐渐流出暗褐色的液体，病菌进一步蔓延之后，鸡腿菇菌盖表面会产生瘤状突起，菌柄畸形膨胀－菇体变形，变质发出腐臭味最后烂掉。
防治措施：栽培场所周围和菇棚内的地面及四壁喷洒500倍多菌灵溶液或100倍抗菌先锋，并喷洒菊脂农药，防止害虫潜入。覆土用远离菇棚的新鲜土，在土中喷洒500倍多菌灵溶液或100倍抗菌先锋溶液。发病时加大菇棚通风量，降低棚内湿度，将温度降至15℃以下，在病区喷洒500多倍多菌灵。发病严重时，去掉原有的覆土，将病菇烧掉，所用工具进行消毒。
2、软腐病
发生此病时，床面覆土周围出现白色霉斑，若不及时处理，霉斑便迅速蔓延，并变成水红色。在鸡髓菇整个生长发育阶段都会受到这种病害的侵染，被侵染的料面，一般不出菇，少数子实体受到浸染后，并不发生畸形，但后期病斑可接连成片，逐渐变成褐色直至腐烂。
防治措施：局部友生时喷洒500倍多菌灵溶披，降低地面和空气湿度，患病部位撒生石灰粉。
3、鸡爪菌
鸡爪菌学名叫总状炭角菌，是鸡腿菇生产中常见且危害较严重的病原菌，可造成减产甚至绝收。
总状炭角菌丝与鸡腿菇菌丝混合在一起，其传播方式及与鸡腿菇是拌生，寄生、还是感染，是寄生性杂茁还是竞争性杂菌等问题目前学术界尚无定论，具专家分析，主要与菌种携带及栽培环境有关。在舂、秋季节，温度高于20℃时，授易出现，多在二潮菇以后出现。
防治方法：①、应使纯菌种，菌种培养料灭菌要彻底最好用高压锅灭菌。
②、脱袋覆土栽培时，要仔细检查菌袋内菌丝生长状况，将出现有菌丝体呈索状，变黄的菌袋，疑为侵染总状炭角菌的菌袋，应单独栽培，以防止扩散传染。
③、在气温较高时，应采取不脱袋，即在袋口内小覆土栽培，栽培袋较长时可在中间截成两段，断面朝下，上面覆士，这样可防止鸡爪菌传染。
④、出现鸡爪菌时，及时挖出菌筒和取出覆盖的土壤，防止传染整个菌床。
⑤、发现鸡爪菌时，用鸡爪菌立灭王粉剂撤在鸡爪菌上，鸡爪菌吸药后会在短时间内中毒死亡。
⑥、栽培场地和覆盖用土，在土壤中喷洒多菌灵或甲醛进行消毒。
⑦、降低栅内温度，把棚内温度控制在20℃以下，不会发生鸡爪菌。
4、黑头病
鸡腿菇菌盖上出现黑色斑头，其病原菌为轮枝霉菌，是一种常见病害，造成鸡腿菇质量下降，黑头病在温度15℃～25℃之间，湿度大时易发生，主要是通过土壤，空气传播。
防治方法：
①、栽培场地应选择没有种过鸡腿菇的场地，应喷洒0.1%多菌灵或1:200～300的克霉灵，或100倍抗菌先锋溶液对场地进行除菌。
②、覆土要选择没有种过鸡朋菇和其它食用菌的场地内的土壤，取菜园土时，要去掉表层10cm以上土壤，取下层土壤使用，在土壤中喷洒500倍多菌灵或100倍抗菌先锋溶被杀灭土壕中病原菌。
③、染病后，加强通风换气，及时摘除病菇。
5、变色菇
菇体菌柄出现褐色，或菌柄全变成褐红色，但不腐烂，生长发育正常，但会降低商品质量。主要是疆土层含水量值高，子实体上水分过重造成的。
防治方法：
①、出菇期间，不能在菇律上喷水。
②、隧道内栽培时要防止水珠渣在菇捧上，顶部有水珠时，要用无滴膜隔离。
③、子实体生长期向，覆土层以偏干为宜。
6、畸形菇
子实体菌盖小或菌盖下部展开，是一种生理性病害，主要是由氧气不足，二氧化碳渡度过高而造成的。
防治方法：①、出菇期要加强通风换气，降低二氧化碳浓度。②、出现畸形菇后，及时摘除，并改善环境条件，让其它子实体恢复正常生长。
7、褐色鳞片菇
子实体菌盖表面长出许多翘起的鳞片，并变成红褐色，从而降低商品质量。是由环境湿度低，光照强造成的。
防治防法：①、出菇期间，使环境处于黑暗或弱光环境下，长出的菇体长洁白，菌盖表面光滑，鳞片少。②、子实体生长期间，要减少通风量，防止干风直接欧向菇体，降低菇体上水分，将空气相对湿度保持在80%～90%之间。
8、褐色石膏霉
鸡腿菇覆土层上长出一层白色至褐色霉层，初期为白色，后变为褐色粉状，从而影响子实体生长，其病原菌为褐色石膏霉，又叫丝甚孢霉，它在自然条件下生长在土壤审的有机质上，在高温和高湿环境下极易发生。
防治方法：①、覆盖用土，采取去掉面表土后的下层土，土壤中有机质含量少。②、栽培场地，应选择没种过鸡腿菇、双孢菇等食用菌的场地。③、出现该病后，喷洒0.1%的多菌灵，或2%甲醛溶液来抑制其生长。
9、子实体干枯病
子实体顶部干枯，萎缩，生长停止，主要空气相对湿度低，干风直接吹向子实体，造成菇体顶部失水干燥生长停止，继面出现我萎缩死亡。
防止措施：①、子实体生长期间减少通风量，防止风直接吹向子实体，保持空气相对湿度在80～90%之间。②、出菇干枯萎缩后，及时摘除，减少通风量，在人行道和墙壁上洒水来增加湿度，让其它鸡腿菇正常生长。
二、虫害防治方法
危害鸡腿菇的害虫主要有嗜菇瘿蚊及其幼虫（就是常说的菌蚊、菌蛆），黑腹果蝇及其幼虫（菌蝇，菌蛆）跳虫、螨类，线虫、蛞蝓（鼻涕虫）等。
防治方法：
①、菇房在使用前喷洒一次农药，杀灭害虫后再撒上一层石灰面。
②、发菌期间，棚内地面、墙壁、袋子上喷洒长效杀虫剂优士。
③、覆土后，出菇前喷洒一次氯氰菊脂。
④、安装纱窗、纱门，以防菌蚊、菌蝇飞入。
⑤、若虫害严重，出完一潮茬后，可用保粮药（磷化铝）熏蒸或喷洒氯氰菊脂。
⑥、出菇期间，用粘虫纸板，或灭蚊灯诱杀，或者取腐烂子实体掺人农药，置盘中诱杀。
⑦、喷洒农药时，不能使用敌敌畏、水胺硫磷等农药，以免引起子实体出现农药中毒，长成畸形菇。
