1、幼菇不分化
幼菇不分化的原因有两方面。
(1) 棚温偏低棚温低不适合幼蕾发育分化。处理方法:通过提高棚温即可解决。
(2) 药物影响为防发病有的菇农使用大量农药拌料，甚至发菌期间也喷洒农药，结果使菌袋内废气浓重，抑制菌丝发生。处理方法:将料面划破后，喷施6%石灰水溶液，每天两遍，连续2～3天，静养发菌，待再次现蕾时，即可转入正常管理;如果使用的药物浓度较高，则需采取石灰水浸泡菌袋的办法予以解决。
2、幼菇长速慢
幼菇长速慢原因是棚温过低，或所选菌株不适合当下的温度。处理方法是提高棚温。
(1) 安装大棚水温空调器温度随意可调，即使选用了中高温型菌株，也可正常出菇。
(2) 安装土暖气注意要点是烟道一定要顺畅，并要保持足量的进风，以免棚内氧气不足。
(3) 晒棚在棚顶部拉设黑色塑膜或高密度遮阳网，卷起草苫，棚内进热不进光，效果不错，但是，雨雪天气则无法增温。有低压炉的栽培户，可将“小白龙”在棚内靠墙安放一圈，最后接到锅炉上，水烧开后的蒸汽源源不断的输送到塑管，给菇棚加温，效果很好。如果是中高温型菌株，又无力升温，则可降温、降湿，待气温回升时再行出菇。
3、菌盖毛刺
菌盖毛刺即菌盖上出现一些疙疙瘩瘩的菌肉组织，很是影响菇品质量，主要原因是棚温低，或菌株不是真正的低温型。真正的低温菌株，如2006等菌株，即使0℃以下也不会发生毛刺等畸形菇。处理方法:增温保温。
4、菜花疙瘩、粗菌柄
前者是菇蕾不分化，后者是菌盖组织不分化，主要原因是棚内二氧化碳浓度高、氧气供应不足。处理方法:强化通风。
5、菌盖上翘喇叭
主要原因有药物作用、通气不良、菌株种性退化或菌株的温型与该时段条件不符合。处理方法:如果是基料中有化学药物，可参考“幼菇不分化”的处理方法;通气不良时，应在晴好天气的中午时段进行通风;种性退化则无法可治，菌株温型不适合该季节，可采取升高棚温的办法解决。
6、气生菌丝非常旺盛
主要原因是碳氮比失调，氮元素过多。处理方法:对料面喷洒浓度为5%左右的石灰水，或者用石灰水浸泡菌袋使氮挥发，使之尽快达到可同化水平;同时加强通风，使气生菌丝尽快倒伏，扭结现蕾。在以后的生产中，应注意调配基料营养，使之全面均衡，尤其应加入三维精素，才能避免该类现象的发生。
7、不出菇
主要原因除基料营养的不均衡和碳氮比失调以外，还有菌株的温型不符合现阶段温度等原因。此外，基料中含有不明物质，尤其是农药类，对菌丝产生抑制，导致不出菇。处理方法:参考上述使用石灰水溶液进行处理。
8、子实体基部长“菌毛”
子实体基部有“菌毛”发生，菇品显得不周正，商品质量低下。“菌毛”有的是白色的菌丝因为通气不良、湿度较高，使食用菌长出气生菌丝;有的则是真菌性感染，前期表现为菌丝状，一旦温度上升，就会发展成病害，如褐腐病等即为该种表现。处理方法:清理料面后，喷洒400倍左右的百病傻溶液，降低湿度，观察一周左右不再发展，即可转为正常管理。
