棉花种子包衣后，不应作长期贮藏，由于用剩包衣棉籽带剧毒农药，无法转商，只能深埋处理，既浪费种子，又会污染环境。只要认真做好安全贮藏，种子发芽率和田间出苗率仍能基本保持原有水平，翌年仍能使用，既能节约种子，又增加经济效益。包衣棉籽贮藏特点和方法简介如下：
1、脱绒包衣棉种易于在夏秋两季吸潮、发热、降低发芽率。因此，必须堆成通风垛，在种垛上、中、下各处均匀放置温度计，掌握温度的变化情况。高温潮湿季节须每天检测1次，棉籽温度须保持在20℃以下。如有异常，迅即采取倒仓或通风降温等措施。最好放入低温库保存，确保种子安全越夏。
2、脱绒包衣棉籽种皮脆、薄、机械损伤多。如压力一大往往出现种皮破裂的情况。因此，仓贮中袋装种子高度不应超过2m。
3、包衣棉种带有剧毒，发出刺激性气味，仓内不应贮存其他种子。同时，应注意人身安全，以防中毒。
