鸡粪是一种比较优质的有机肥，其含纯氮、磷（P2O5）、钾（K2O）约为1.63％、1.54％、0.085％。但是鸡粪不被处理或腐熟而直接施用到作物上，则存在很大的害处及隐患，主要表现在：①传染病虫害。粪便中含有大肠菌、线虫等病菌和害虫，直接使用会导致病虫害的传播、作物发病，对食用农产品的人体健康也产生影响；未腐熟有机物料在土壤中发酵时，容易滋生病菌与虫害，也导致植物病虫害的发生；②发酵烧苗。不发酵的生粪等有机物料施到地里后，当发酵条件具备时，在微生物的活动下发酵，当发酵部位距根部较近且作物植株较小时，发酵产生的热量会影响作物生长，烧毁作物根系，严重时导致植株死亡。③毒气危害。在分解过程中产生甲烷、氨等有害气体，使土壤和作物产生酸害和根系损伤。④土壤缺氧。有机质在分解过程中消耗土壤中的氧气，使土壤暂时性的处于缺氧状态，会使作物生长受到抑制。⑤肥效缓慢。未发酵腐熟的有机肥料中养分多为有机态或缓效态，不能被作物直接吸收利用，只有分解转化成速效态才能被作物吸收利用，所以未发酵有机肥直接施用时使肥效减慢。
