食用菌害螨
螨类是食用菌害虫的主要类群，俗称菌虱，它们直接取食食用菌丝和子实体，发菌后出现“退菌”现象，并使培养料变黑腐烂、菌丝萎缩，子实体出现凹状的斑眼、枯萎。若为害菇（耳）根，可影响出菇（耳），造成子实体腐烂和畸形，有的还可传播杂菌和病原菌。食用菌中螨的种类很多，危害较大的主要有蒲螨和粉螨两种。蒲螨体形小、瓜籽形，淡黄色或深褐色，肉眼不易看见，多在料面或土粒上或子实体上集中成团，类似“土粉”散落状，粉螨体形较大，白色发亮，不成团，数量多时成粉状。
防治措施：1.引种时避免菌种带螨。2.搞好环境卫生，减少杂菌污染。3.及时处理菌种瓶和栽培料。4.用1.8爱福丁或其复配药泡水2000-3000倍喷雾。
菌蛆
菌蛆是危害食用菌的双翅目昆虫幼虫的总称，它的成虫人们通常又分别称为菇蝇、菇蚊和菇蛆（瘿蚊）等之类，而每一类又各包括许多种类，它们以蛆形幼虫取食各种食用菌的菌丝和子实体，并传播病原菌，危害严重时直接影响食用菌的生产。
防治措施：1.菇房门窗应装纱门，以防成虫飞入产卵。2.消除菇房周围垃圾，房内地面撒生石灰。3.用1%的847农药（氯氰菊脂和辛硫磷配合而成）喷洒菇房四壁、地面和床架，或用硫磺（5克/立方米）多点烟熏，密闭48小时，过1-2天后进袋。4.药剂防治有用1.8爱福丁2000-3000倍液或用5%锐劲特1500倍液喷雾。
