农药对果树的影响 农药施用后,一部分残留于枝叶及果实表面，一部分渗透到果树角质层或组织内部造成不同程度的药害。急性药害可使叶片、果实出现斑点、黄化、失绿、枯萎、卷叶、落叶、落果、缩节簇生等;慢性药害可使果树光合作用减弱、花芽形成延迟、果实成熟延迟，味道、色泽恶化，甚至导致果树死亡等。
农药对土壤的影响 果树施药后部分农药直接进入土壤，被土壤颗粒吸附;大气中的残留农药和果树上的农药经雨水淋洗落入土壤中直接或间接地与土壤微生物接触，杀灭土壤微生物，从而影响土壤的腐熟和透气性，破坏土壤团粒结构，降低土壤肥力，影响果树生长发育。
农药对水与大气的影响
喷洒的农药一部分残存在枯枝落叶或土壤中，通过降水冲刷或灌溉进入沟渠、池塘、湖泊、江河中污染水域，影响水生生物的生长发育。同时喷洒农药时农药颗粒随风移动污染空气。
农药对果园昆虫的影响
农药在杀灭害虫的同时也将天敌杀死，破坏了生物链及果园生态平衡，同时使害虫产生抗药性，导致害虫种群数量急剧上升。有些次要害虫由于天敌数量的急剧减少，很快发展成为主要害虫。另外，大部分农药对蜜蜂具有杀伤作用。
农药对人畜的影响 一方面，农药在施用过程中可以通过呼吸道、皮肤、消化道直接进入人畜体内造成直接危害;另一方面，在果品、土壤、水中的农药残留通过饮食或食物链进入人畜体内，造成间接危害。
