（1）因棚内无昆虫媒介传授花粉，所以棚内栽培西瓜因授不上粉而不坐果。甜瓜虽属雌雄同花，但棚内湿度比露地大，又无大风，所以花粉飞散困难，也不容易授上粉，所以无论大棚或小拱棚栽培西瓜、甜瓜都必须进行人工授粉或用坐果灵等进行处理，但有时坐果类药物会造成畸形、裂瓜或苦瓜现象，使用时亦应注意浓度和温度。
（2）棚内水肥条件好，容易发生植株徒长。秧子长的特别旺盛时也不坐瓜，即植株生长过旺、茎粗、叶大、生长迅速，果实养分被秧子所剥夺，出来的瓜纽个个是畸形，大头小尾，遇到这样现象除打去所有小杈外，把2－3条主蔓的稍上抠下豆粒大小一块(生长点)，促使养分集中供应果实。此时还要看秧子长短，如果是2米多长时，蔓稍就可掐掉半寸或一寸长。大棚栽培时，尽量不用大型西瓜品种，要选早熟易坐果的品种，另外应先试种后投产，以免有的品种不适应大棚栽培。
