黄瓜病虫害较多，尤其是保护地栽培，黄瓜生长发育最适宜的环境条件，也适合多种病虫害发生，这就成了发展黄瓜保护地栽培的主要制约因素，用药量大，投工多，有的一亩地黄瓜光农药费就达800—1000元，经济效益下降，而且农药残留超标，危害人命健康。中国加入WTO后，中国农业生产要与国际接轨，否则产品即不能出口，在国内也进不了超级市场。这就要求我们必须发展无公害的绿色食品，在防治黄瓜病虫害上，尽量做到不用农药，少用农药，使用高效、低毒、少残留的农药。总的原则就是：贯彻“预防为主，综合防治”的植保工作方针，坚持以“农业防治为基础，优先采用生物防治，物理防治，科学使用化学防治”的综合防治技术。
1.农业防治
采用合理的农业技术措施，为无公害栽培打好基础，如选用抗病虫良种，种子浸种消毒，培育无病壮苗，清理田园减少病源，实行轮作换茬，更换病土，合理的肥水管理，及时植株调整及采用嫁接育苗等农业技术措施，防止病害的发生和蔓延。
2.生物防治
生物防治是利用病虫害的自然天敌、生物肥料、生物杀菌及生物杀虫剂，实现防治病虫害的目的，如利用寄生性天敌丽牙小蜂防治棚室白粉虱；利用七星瓢虫、草青蛉防治蚜虫、叶螨、红蜘蛛及白粉虱。生物制剂可以干拢害虫的生长发育和新陈代谢，虽然效果较慢，但对作物、人、畜安全。用阿维菌素类生物农药防治螨类、美洲斑潜蝇，根结线虫；喷洒农用链霉素防治细菌性病害；用农抗120和多抗霉素防治白粉病霜霉病，用2%的武夷霉素防治灰霉病和白粉病等，都是有效的无公害防治方法。
3.生态防治
实践证明低温高湿是黄瓜白粉病、霜霉病和灰霉病等真菌性病害发生的主要生态条件，在叶片有水膜的条件，气温在15—20℃，空气相对湿度在85%以上，是以上病害发生蔓延的生态环境条件，所以在棚室管理上要人为的调节温、湿度，减轻病害的发生。其做法是上午根据室外温度的高低和棚室内温湿度的高低，放风0.5—1小时，然后密闭棚室，将温度提高到28—30℃，这样就能抑制病害的发生，利于黄瓜进行光合作用，下午放苫前将温度调整到22℃左右，湿度70%以上，晚上湿度虽然上升，但使温度下降到10—13℃，也限制了病菌孢子的萌发。还可根据多数真菌喜酸性的特点，在病害刚刚发生时，在叶面喷洒500倍的小苏打，三天一次，连喷5—6次，对白粉病有特效。
高温闷棚对防治霜霉病也是行之有效的方法之一，其方法是：于3月下旬以后，选晴天早晨先浇一遍水，提高空气湿度，以防秧头灼伤，在秧头部位挂2—3支温度计，然后密封棚室，使温度迅速升高，每10分钟观察一次温度，使棚室温度达到45—46℃时，保持两个小时，即可将棚室内霜霉病菌杀死。然后先开天窗慢慢降温，使植株恢复正常生长。隔4天后再闷一次，可以提高防治效果。霜霉病的发生根据有关试验，用尿素1公斤，白糖1公斤，兑水100公斤，在黄瓜生长盛期，每隔5天喷一次，并注意在早晨喷于叶片底面，利用吸收，防治效果可达90%以上。
4.物理防治
利用蚜虫、白粉虱和美洲斑潜蝇对黄色有强烈趋性的特点，在棚室中每隔10米左右挂一块涂有机油的黄色捕虫板，引诱成虫自投罗网，露地黄瓜采用防虫网覆盖也是蔬菜无公害栽培的重要措施。
“臭氧”防治病虫害是现今兴起的无公害防治病虫的理想手段，臭氧是三原子氧，分子式为O3因其有雷电后的臭味而得名，是强氧化剂，O3已被公认为广谱杀菌杀毒剂，消杀范围极广，它能杀死所有病菌病毒，其防病机理是直接破坏RNA或DNA两种核酸。它又是弥漫的气体，棚室内无任何死角，没有污染没有残留，O3的杀菌能力是氯的二倍，杀菌速度是氯的300—600倍，是紫外线的3000倍，当臭氧溶于水后，喷洒蔬菜有更强、更快的杀菌效果，臭氧已被科研单位鉴定为：高效、无二次污染的洁净氧化剂。臭氧发生器已有多家生产，在香瓜、西红柿、辣椒等大棚施用，节省农药90%以上，在黄瓜大棚施用，防治效果达75%以上，既省工又省钱，而且结果率高、早熟、增产20—30%，节约经费90%。臭氧机以空气为原料，接电后10分钟就可以让大棚充满足够灭菌、杀虫浓度的臭氧，使棚室不用或少用农药的情况下，达到防治病虫的目的，约半小时后臭氧又还原为氧气，这就为发展绿色食品生产提供了又一项新技术。
5.化学防治
无公害不是所有的化学农药都有害，关键是选用农药和科学的施用农药，国家已严禁在黄瓜上使用高毒高残留农药，所以应尽量选用一些低毒低残留的生物农药，以提高黄瓜的质量，保护人民的身体健康。
