为了解决养猪最难处理也最不容易见到效果的环保问题，从2005年开始，在山东、福建等省兴起了发酵高床养猪（有的叫自然养猪法）的新技术，现在，很多省份特别是养猪业发达的地区，也都采用该方法养猪，不过大部分在试验、观察效果。很多从事研究的专家和菌种生产厂家认为垫料可以使用3年，也吸引了一部分规模化大型猪场进行试验研究。
发酵高床养猪在管理到位的情况下确实能解决环保问题，没有污水排出来，也减少了冲猪舍的水量，另外，猪舍的氨味及其他异味大幅度减少，猪只的健康水平有所提高，猪只发病数量明显减少本场做了4个猪栏，垫料厚80cm，谷壳和锯末各半，从2008年9月份开始试验，每个栏36 m2（包括6X1m2的喂料平台），放25～30头猪/栏，现在第2批试验猪已准备出栏。在试验的过程中，遇到一些问题，提出来与同行探讨一下。
1 、原料问题
从环保的角度出发，垫料只要能用1年时间，不要说3年，只要成本适当，很多猪场都会使用。但是，垫料的量是一个问题。每平方米的垫料（80cm厚），需要谷壳和锯末各4包（30～35kg重）左右，因此，原料的需求量非常大。锯末中，根据专家介绍，桉树的锯末由于不利于菌种的生存而不能使用，只能用其他树木的。如果大范围推广该技术，原料（除了谷壳和锯末）的筛选工作比较重要，因为要有足够的量，而谷壳和锯末的量毕竟有限。
我国很多地区要么小麦产量大，要么大米产量大，或者玉米生产量大，而这些作物的秸秆作为农副产品多作为肥料或家畜的饲料使用，价值发挥不充分。如果能粉碎后作为重要的一种垫料成分，应该能解决这一问题。即使这些原料降解的速度与锯末比比较快，但如果能用一年时间，不断进行补充，也会节约相当可观的成本。
2 、垫料位置问题
做发酵高床的猪栏，一般垫料层深60～80cm，而地面多数是不铺水泥的（要求是一定不铺），在山东等地，料床是挖到地下的，床面和地面平，这种做法一方面节约做砖墙的成本，另一方面，添加饲料、驱赶猪只十分方便。这种地下栏在北方比较适合，因为气候比较干燥，地下水位底，不容易渗水在南方，大部分猪场建在山区，并且很多猪舍是围着山脚而建，如果采用这种方法，由于南方气候潮湿，山区的地下水位一般比较高，如果下面又没有铺设水泥地面，当地下水渗透到一定程度时，垫料下层湿度过大，容易变质。
区别不同地区的情况，垫料的位置是在地上还是地下不要一个模式。南方最好在地面上建发酵高床，但可以在下面铺一层稻草，以减少地下水份的影响。
3 、建筑面积问题
根据很多资料和专家的介绍，发酵高床养猪密度为1.2～1.5 m2/头，但没有说明是根据整个栏的面积还是垫料床的面积算出来的。如果是整个栏的面积，那么要把水泥地面的部分（吃料台和饮水台，有的还有凉台。大的占总面积的四分之一，小的也有十分之一以上）减去，按垫料面积来分，可能一头猪也就占1 m2左右， 作为大猪来说，1 m2的垫料每天要分解1.5 kg左右的粪便，还有尿液，应该承受能力达不到，效果也不理想。如果单单是根据垫料面积来算，到大猪的时候，加上饲料台、饮水台，平均每猪占据面积要1.8～2.0 m2，可能在建筑面积方面要增加相当成本，那就不是每个猪场都能承受得了的。
